Мисија Фонда за иновациону делатност је да допринесе укупном развоју иновација применом различитих финансијских инструмената којима се подстиче оснивање нових компанија и јачање постојећих, њихово усмеравање ка тржиштима капитала и привлачење директних страних улагања у високе технологије и развој.
Његов циљ је такође и да унапређује везе између истраживања, технолошког развоја и привреде, подстиче и подржава развој иновативних технологија.
У оквиру свог рада, Фонд нуди следеће програме: